為進一步推動水源地保護攻堅戰向縱深發展，5月20日，生態環境部組織啟動全國集中式飲用水水源地環境保護專項第一輪督查。273個督查組抵達督查地后，立刻投入工作。
5月20~21日，各督查組按照督查工作計劃，與當地政府及有關部門座談了解飲用水水源地環境保護工作情況，重點核查專項行動實施方案、問題整治方案、水源地基礎文件、問題整改進展等情況。總體上，各地高度重視飲用水水源地保護工作，有序推進相關環境問題整治。同時，督查發現，部分地區整治工作仍存在一些突出問題：
一是部分地方整治工作進度滯后。按照國務院批準的專項行動方案要求，各地應于2018 年3 月底前完成水源地環境違法問題排查，并制定問題整治方案。截至5月21日督查組到達現場開展督查工作，仍有部分地方尚未制定完成整治方案。河北省唐山市、山西省晉中市、河南三門峽市、四川省綿竹市、安徽省蚌埠市固鎮縣尚未完成整治方案制定，給后續工作帶來巨大壓力。
二是部分地方整治方案不認真。云南省曲靖市、湖南省岳陽市岳陽縣、江蘇省南京市、吉林省白山市、河北省唐山市、山西省運城市、陜西省安康市、山東省泰安市、日照市、威海市等部分飲用水水源地雖然制定了整治工作方案，但沒有明確責任單位或者責任人，具體措施和任務分工比較籠統，可操作性不強。
三是部分地方沒有落實信息公開要求。根據專項行動方案，各地應公開問題清單，定期發布整治進展情況。目前，湖南省湘西州保靖縣公開了專項行動實施方案，但沒有公開問題清單和整治進展情況;湖南省永州市個別縣區未按照要求開展信息公開工作。
在審查有關資料的基礎上，各督查組將開展現場督查工作，對保護區內存在的環境問題和群眾投訴舉報線索進行逐一核實。有關地方政府明確表示，將按照全國集中式飲用水水源地環境保護專項行動的要求，全面整治水源地環境違法問題，認真推進飲用水水源地環境保護工作。
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